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一、本站組織
本站目前為丙等航空站，組織編制分業務組與航務組2組，現有人員計有主任、航務員、組長、組員、副工 程司、技工及工友等職務，本站尚未補足預算員額，計有職員11員、約雇消防員8員、工級人員 27員合計46員，略分為行政人員17人，航務人員3人，消防人員26人。
本站於88年10月榮獲ISO9002國際標準組織品質管理認證，於91年6月再獲ISO 9001 2000版國際標準組織品質管理認證，並於97年6月通過續評，肯定本站服務品質已具一定水準。
二、各單位業務職掌
本站掌理航站經營管理、旅客及航空公司服務、地面飛航安全執行與管理及場站設施建設與維護。各單位業務職掌詳列如下表：
各單位業務職掌表
項次
職稱
掌管業務
(一)
主任
綜理站務。
(二)
航務組：
航務員3人
負責飛航安全、航空人員及航空器之查驗、航機放行、機場消防、救護等航務管理業務。因本站未設置氣象諮詢臺，故兼辦提供航空氣象、飛航公告及飛航計劃書審核等服務工作。並兼辦政風業務。
(三)
業務組：
組長1人
組員4人
負責場站之營運管理、旅客服務事項、綜合研考、總務、人事、會計、機電、環境清潔美化及督導航站消防等業務
(四)
副工程司1人
負責場面及場站服務設施維護修繕。
(五)
技工友10人
負責資訊、企劃、財產、出納、場站設施修繕維護、場面及車輛維護、公文收發、檔案管理。
(六)
組員1人（消防班長）
消防技工17人
負責航機消防搶救及場站消防設施維護。
(七)
約僱消防員8人
三、人力消長情形(員額配置運用)
編制、預算及現有人力情形
金門航空站編制、預算及現有員額數統計表
員額 年度
編制員額數
預算員額數
現有員額數
職員
技工友
約僱 人員
合計
90
23
17
0
40
13
30
11
29
91
92
93
24
37
94
26
39
95
10
50
4
43
96
27
6
46
12
45
97
28
8
49
48
98
99/1
本站為充實消防人力95-97年奉行政院人事行政局核定改招約僱消防員10員，期間共招考8名約僱消防員，並接收埔里榮民醫院移撥1名工友及金門國家公園移撥1名技工為消防技工，98年7月8日1名工友意外死亡，目前行政人力尚超額1名工友及7名技工，採退離後遇缺不補方式處理。
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